Deferiprone bekerja dengan cara mengikat ion besi berlebih dalam darah dan jaringan, kemudian membentuk kompleks yang akan dikeluarkan melalui urin. Mekanisme ini membantu menurunkan kadar ferritin dan mencegah kerusakan organ vital seperti jantung, hati, dan kelenjar endokrin akibat penumpukan zat besi.